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知识分享‖神经环路示踪技术的发展历程


Hagmann P,et al.,PLoS Biology,2008

脑是人体最神秘、最复杂的器官,由近1011个神经元组成,形成约1014-15个突触,这种复杂的神经环路网络为认知、情感、记忆、感觉和运动等大脑高级功能建立了稳固的结构基础。如何认识神经元的连接方式,描绘神经环路的精细结构并认知其功能对于了解大脑的复杂功能至关重要。科学家们一直致力于找到可以特异性标记细胞种类、传导方向可控、可视化的示踪工具,以期实现对神经环路网络的精确认识和研究。

利用神经示踪工具实现对神经环路的精确标记,主要涉及两大基本问题即方向性(顺向、逆向)和是否跨突触。顺向(Anterograde)是由注射部位的神经元胞体经轴突下行至末梢,逆向(Retrograde)是由轴突末梢传到细胞体;顺向跨突触是从胞体传到轴突末梢后跨过突触传递至下一级神经元,逆向跨突触跟顺向跨突触相反,是由胞体逆向跨突触传递至上一级神经元的轴突。如下图所示:


Strick P L,et al.,eLS,2011


V带领大家一起了解神经环路示踪工具的发展历程,共同感受神经科学研究领域的飞速进步。



传统神经示踪工具


最早的神经示踪剂是放射性标记的氨基酸,如氚化亮氨酸和脯氨酸,用放射性核素取代化合物分子的一种或几种原子而使它能被识别并可用作示踪剂,利用放射性探测技术来追踪这些示踪剂,但放射性标记示踪剂很快被光学显微镜可检测的示踪剂所超越。这些用途广泛、敏感性强,并能选择性进行顺行、逆行标记的物质被应用到神经环路的研究中,成为传统示踪剂,如染料、蛋白质和肽类标记物等。种类主要有:

种类

名称

特点

辣根过氧化物酶

辣根过氧化物酶(HRP)

逆行示踪剂,染色局限于细胞体和初生树突

蛋白

霍乱毒素B亚基(CTb)

逆行示踪剂,无毒

荧光染料

荧光金(Fluoro Gold)

逆行示踪剂显示树突分支,易观察,不易扩散

羰化青Dil

逆行示踪剂显示轴突,荧光强而稳定,无毒,不易扩散

生物素

生物素化葡聚糖胺BDA

顺行示踪保存时间长,可与多种荧光示踪剂及免疫组化技术相结合

凝集素

麦芽凝集素(WGA)、菜豆凝集素(PHA)

顺行示踪剂注射后需要较长的存留时间才能实现转运

上述这些传统的示踪剂被广泛用于确定实验动物不同脑区之间神经元的连接,促进了人们对大脑神经网络结构的认识,但它们仍有以下缺点:无法特异性标记细胞类型几乎没有跨突触能力不能用于传递外源基因难以用于多个脑区、多种类型神经元通过突触连接形成的复杂神经网络研究。

病毒示踪剂的出现为上述问题的解决提供了新方案,并成为追踪神经网络连接的有效工具。


病毒示踪工具


应用于神经环路标记的病毒示踪工具大多由嗜神经病毒改造而来。嗜神经病毒能感染神经细胞,沿神经环路跨突触传播,这些特点使其成为绘制神经环路的理想工具。常用的嗜神经病毒示踪工具主要有单纯疱疹病毒Herpes simplex virus,HSV伪狂犬病毒Pseudorabies virus,PRV狂犬病毒Rabies virus,RV水泡性口炎病毒Vesicular stomatitis virus,VSV 其特点如下表所示:

病毒名称和描述

顺向跨突触病毒

HSV

dsDNA~152kb包装容量~130kb毒力和传播方向具有菌株依赖性。H129株优先顺向跨突触示踪

VSV

-ssRNA,11-12kb包装容量<6kb对人的毒性较低,极短时间高丰度表达目的蛋白,可被其他病毒的囊膜糖蛋白包装而获得不同方向的跨突触能力

逆向跨突触病毒

RV

-ssRNA11.9kb包装容量<6kb要标记神经元,可导致致命的人畜共患疾病。改造的复制缺陷型RV毒性较低

PRV

dsDNA~150kb包装容量~130kb不能感染高等灵长类;野生型PRV毒性极高且双向传播。改造的PRV-Bartha株逆行跨突触示踪毒性较低

上述嗜神经病毒在神经环路的标记中具有很强的感染性和特异性,但其免疫原性很强,对细胞的毒害性亦大:感染一段时间后会导致神经元病变,甚至可导致被感染实验动物死亡,对环境和实验人员存在潜在危险,需在生物安全2级以上实验室操作,所以在使用嗜神经病毒进行研究时仍需慎重。因此,开发一种免疫原性及毒副作用极低的神经示踪工具病毒是非常有必要的。
腺相关病毒(Adeno-associated virus,AAV是目前已发现的结构最简单的一类单链DNA复制缺陷型病毒,具有安全性高、免疫原性低、宿主细胞范围广和在体内表达时间长等特点。科学界现普遍认为AAV不会导致人类疾病,是目前最有前景的基因治疗载体。
基因工程化的AAV能转导外源基因,借助特定启动子、光遗传学/化学遗传学元件、钙指示剂、神经递质探针或Cre/lox P,Flp/FRT重组酶技术,可选择性地标记特定的神经元。越来越多的神经环路研究使用AAV作为神经示踪工具。

AAV血清型种类多,不同的血清型对神经元有不同的感染特性。神经科学研究中常用的AAV血清型有2589DJ1/2PHPAnc80等,它们有高效转导神经元的能力,可根据标记的神经元选择合适的AAV血清型此外,科学家也一直致力于AAV新血清型的开发研究,近日国际基因治疗领域著名专家高光坪教授及其课题组鉴定出一种新AAV血清型AAVv66其与AAV2具有高度序列相似性,但比AAV2产率更高、病毒稳定性更高及更好的中枢神经系统转导能力,通过颅内和全身注射给药时AAVv66在脑组织内分布较AAV2更好

常见的AAV病毒载体都是顺向非跨突触标记,AAV的逆向非跨突触和顺向跨突触标记能力在科学家的潜心研究下取得了满意成果,并被广大研究者用于神经环路研究:


  • rAAV2-retro(逆向非跨突触标记)

2016D. GowanlockR. Tervo等通过定向进化的方法构建了一种新的AAV变体 rAAV2-retro该变体具有逆行示踪能力且效率与传统的逆行示踪剂相当,由此AAV的逆向非跨突触标记能力被成功开发。下图所示为rAAV2-retro的开发过程及应用实例:

Tervo et al.,Neuron,2016


  • AAV1顺向跨突触示踪

2017张砺教授团队研究报道AAV1在高滴度条件下呈顺向跨突触传播,与Cre依赖的报告系统相结合,可高效和特异性地驱动Cre依赖的外源基因在突触后神经元中表达,标记突触后神经元。2020年该研究团队再次深入研究了AAV1顺向跨突触标记的作用机制——依赖于突触囊泡的释放,同时揭示了其在多种神经环路中的广泛应用,为AAV作为顺向跨突触示踪病毒工具对神经元及其投射脑区进行标记提供了诸多证据。我们相信AAV在神经环路中的应用将会越来越广泛。研究所用的AAV病毒部分由维真生物提供,欲知详情请点击往期回顾:科讯前沿:南加利福尼亚大学张砺教授团队在AAV1顺向跨单级突触研究领域发表新成果!

AAV转导神经元需要宿主细胞合成其基因的互补链,因此基因的高表达需要较多病毒颗粒和较长时间才能实现。双链AAV(self-complementary AAVscAAV) 进入细胞后,不需要由单链变为双链的过程,基因表达更为快速,表达水平更高,不过scAAV的装载量只有单链AAV的一半例如2020年张砺教授团队的科研论文就使用了scAAV证实了scAAV1-hSyn-Cre具有更优越的顺向跨突触标记能力,可在兴奋性、抑制性、神经调质和脑-脊髓等多种神经环路中有效、特异地标记单突触靶神经元及其输出,从而解析不同的功能/行为。

总 结

理论,只要病毒能感染神经系统,就具备开发成工具病毒的潜力,但是每种神经示踪病毒都有其特异的跨突触标记特性和局限性,虽然病毒示踪工具在神经环路研究中的应用最为广泛,对神经示踪病毒改造也已取得了显著的进展,但仍有许多问题亟待解决,例如病毒跨突触机制跨突触的过程及其对各类型突触结构的选择性跨多突触标记的神经网络如何区分连接级数等。针对上述问题,科学家们一直努力研究改造病毒,以期获得毒性更低感染、传播、跨突触机制更加明确的神经示踪工具病毒为脑科学研究提供更强大工具



维真生物神经示踪工具AAV产品及服务



如有需要,欢迎致电400-077-2566

产品编号

产品名称

AV204006-AVretro

AAVretro-hSyn-Cre

AV204006-AV1

AAV1-hSyn-Cre

AV204046-AV1

scAAV1-hSyn-Cre

AV204006-AV2retro

AAV2 retro-hSyn-Cre

AV204049-AV1

AAV1-hSyn-Flp

AV204050-AV1

AAV1-CAG-DIO-Flp

AV204054-AV1

AAV1-EF1a-DIO-Flp

……

荧光蛋白(标记神经元)

AV200001-AV2retro

AAV2 retro-CMV-GFP

AV200007-AV2retro

AAV2 retro-hSyn-GFP

AV200109-AV1

(Cre依赖)

AAV1-CAG-DIO-GFP

AV200160-AV2

(Cre依赖)

AAV2-CAG-DIO-mCherry

AV200145-AV9

(Cre依赖)

AAV9-EF1a-DIO-mCherry

AV200096-AV2

(Cre依赖)

AAV2-hSyn-DIO-GFP

AV200096-AV9

(Cre依赖)

AAV9-hSyn-DIO-GFP

AV200146-AV9

(Cre依赖)

AAV9-hSyn-DIO-mCherry

AV200117-AV9

(Cre依赖)

AAV9-CaMKIIa-DIO-GFP

AV200147-AV5

(Cre依赖)

AAV5-CaMKIIa-DIO-mCherry

AV200147-AV9

(Cre依赖)

AAV9-CaMKIIa-DIO-mCherry

……

光遗传学(操控神经元)

AV201006-AV2

(Cre依赖)

AAV2-EF1a-DIO-hChR2(H134R)-mCherry

AV201006-AV9

(Cre依赖)

AAV9-EF1a-DIO-hChR2(H134R)-mCherry

AV201007-AV2

(Cre依赖)

AAV2-EF1a-DIO-hChR2(H134R)-EYFP

AV201007-AV9

(Cre依赖)

AAV9-EF1a-DIO-hChR2(H134R)-EYFP

AV201017-AV9

(Cre依赖)

AAV9-EF1a-DIO-eArch3.0-EYFP

AV201021-AV9

(Cre依赖)

AAV9-EF1a-DIO-eNpHR3.0-EYFP

AV201003-AV2

(Cre依赖)

AAV2-CaMKIIa-DIO-hChR2(H134R)-mCherry

……

化学遗传学(操控神经元)

AV202014-AV9

(Cre依赖)

AAV9-EF1a-DIO-hM4D(Gi)-mCherry

AV202010-AV9

(Cre依赖)

AAV9-hSyn-DIO-hM4D(Gi)-mCherry

AV202015-AV9

(Cre依赖)

AAV9-CaMKIIa-DIO-hM4D(Gi)-mCherry

……

钙指示剂(神经元成像)

AV203009-AV2retro

(Cre依赖)

AAV2-retro-EF1a-DIO-GCaMP6m-P2A-nls-dTomato

AV203006-AV8

(Cre依赖)

AAV8-EF1a-DIO-GCaMP6s-P2A-nls-dTomato

AV203006-AV9

(Cre依赖)

AAV9-EF1a-DIO-GCaMP6s-P2A-nls-dTomato

AV203009-AV8

(Cre依赖)

AAV8-EF1a-DIO-GCaMP6m-P2A-nls-dTomato

AV203009-AV9

(Cre依赖)

AAV9-EF1a-DIO-GCaMP6m-P2A-nls-dTomato

AV203009-AV DJ

(Cre依赖)

AAV-DJ-EF1a-DIO-GCaMP6m-P2A-nls-dTomato

AV203016-AV9

(Cre依赖)

AAV9-EF1a-DIO-GCaMP6f-P2A-nls-dTomato

AV203004-AV5

(Cre依赖)

AAV5-hSyn-DIO-GCaMP6s-P2A-nls-dTomato

AV203046

AAV-EF1a-DIO-jGCaMP7b-P2A-nls-dTomato

AV203047

AAV-EF1a-DIO-jGCaMP7c-P2A-nls-dTomato

AV203048

AAV-EF1a-DIO-jGCaMP7s-P2A-nls-dTomato

AV203049-AV9

(Cre依赖)

AAV9-EF1a-DIO-jGCaMP7f-P2A-nls-dTomato

……

另有AAV9AAV-PHP.BAAV-PHP.eB等可跨血脑屏障的血清型AAV产品。关注我们了解更多产品详情~



Reference


1. Saleeba, C., et al., A Student's Guide to Neural Circuit Tracing. Front Neurosci, 2019. 13: p. 897.

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